聚对苯二甲酸乙二醇酯PET分子链可以看作是由三部分组成，柔性的脂肪烃基，刚性的苯撑基，极性酯基。苯撑基是刚性结构单元，阻碍分子链自由旋转，又可以与极性酯基形成大共轭体系，更增大了分子链的刚性。脂肪烃基又赋予分子链一定的柔性，但它的影响小于前两者，所以该聚合物总体上表现出较大的刚性，使其具有较高的玻璃化温度和较高的熔融温度，也可预料材料具有较优异的力学性能。极性酯基可以增大分子链之间的引力，但苯撑基的存在却会使分子链间引力减小。聚合物的内聚能密度在聚合物中属于中等或中等略偏高的水平。聚对苯二甲酸乙二醇酯PET分子链上各基团排列整齐，大分子链规整，分子链上所有苯环几乎处在同一平面，微微呈平面起伏状。不同分子链凹凸部分相嵌，使聚合物的敛集密度较高。规整的分子链使聚合物可以结晶，但较刚的分子链又妨碍结晶过程。因此，聚合物从熔体冷却凝固时绪晶速率较小，只能得到不太高的结晶度。有资料介绍，在一般的制品中该聚合物仅可达到 40%的结晶度。如果对熔体快速冷却，可得到无定形结构。