目前在城市生活污水处理研究和应用领域，普遍存在的问题有：

(1)采用传统的污泥法，往往基建费、运行费高，能耗大，管理较复杂，易出现污泥膨胀现象;工艺设备不能满足低耗的要求。

(2)随着污水排放标准的不断严格，对污水中氮等营养物质的排放要求较高，传统的具有脱氮除功能的污水处理工艺多以污泥法为主，往往需要将多个厌氧和好氧反应池串联，形成多级反应池，通过增加内循环来达到脱氮除的目的，这势必要增加基建投资的费用及能耗，并且使运行管理较为复杂。

(3)目前城市污水的处理多以集中处理为主，庞大的污水收集系统的投资远远超过污水处理厂本身的投资，因此建设大型的污水处理厂，集中处理生活污水，从污水回用的角度来说不一定是可取的方案。许多地方开始采用生活污水处理设备，对污水有一个很好的处理。